З метою оптимізації та вдосконалення діяльності митної системи Державною митною службою України проводиться реорганізація митних органів. Як повідомили у прес-службі Державної митної служби України, створення, реорганізація та ліквідація митниць розпочинається з 01 жовтня 2006 року, відповідно до адміністративно-територіального устрою України.
Серед основних процедур реорганізації відбудеться ліквідація та натомість створення кількох регіональних митниць з безпосереднім підпорядкуванням ДМСУ, згідно 14, 15 статей Митного кодексу України. Серед них : ліквідація Північної регіональної митниці і створення Центральної регіональної митниці (місце розташування – м. Київ); ліквідація Львівської митниці і створення Західної регіональної митниці (місце розташування - м. Львів); ліквідація Донецької митниці і створення Східної регіональної митниці (місце розташування - м. Донецьк); ліквідація Одеської митниці і створення Південної регіональної митниці (місце розташування - м. Одеса); ліквідація Кримської митниці і створення Кримської регіональної митниці (місце розташування - м. Сімферополь).